4.1.1 將儀器置于平穩的操作臺面，將各附件逐個安裝妥當，把電源線插頭插入匹配的電源，開機后看是否能夠正常運轉。 
4.2 使用前的準備工作 
4.2.1 將儀器置于平穩的操作臺面，其工作環境應避免震動和化學物質的侵蝕。 
4.2.2 將懸桿、排液槽安裝在的部位。 
4.2.3 插上電源，打開儀器電源開關，操作面板顯示設定的轉速旋轉ADJ調整旋鈕到預定的轉速（一般為60~120轉/分） 
4.2.4 啟動機器按START/STOP 按下時泵開始工作，機器上放的紅色指示燈亮，再按抬起時泵停止工作。 
4.3 無菌檢測操作過程 
4.3.1 取出一次性培養器先檢查包裝是否無損，在無菌室內打開無菌包裝。 
4.3.2 將一次性培養器逐個插放在不銹鋼排液槽上。 
4.3.3 將一次性培養器的彈性軟管裝入集菌儀的蠕動泵頭，要求定位準確，軟管走勢順暢。 
4.3.4 用中間的針孔插到樣品瓶里，然后用尾端針孔插到稀釋液里，開機，將稀釋液倒置，把液體打入樣品瓶中，樣品瓶中液體加滿后，放下稀釋液，再倒置樣品瓶，使樣品通過培養器進行集菌。 
4.3.5 完成集菌后，開啟已滅菌好的培養基瓶，將前端針頭插入培養基中，稀釋液瓶中針孔不要拔出。 
4.3.6 摘下一次性培養器頂部空氣濾器開口的膠塞，套在一次性培養器的底口上， 
4.3.7 用夾子夾閉與一次性培養器連接部的軟管，留出5-6cm軟管，剪除其余部分，并將開口端插在空氣濾器的開口上。 
4.3.8 分別按照規定時間培養。 
4.3.9 觀察培養情況，若需取樣分離培養，可將軟管消毒，用無菌注射器插入軟管抽取所需；量做進一步檢查 。 
4.4 微生物限度檢測操作過程 
4.4.1 取濾膜（直徑50mm）N張，浸泡在純化水里約5分鐘。 
4.4.2 用鑷子取出濾膜，平帖在不銹鋼網面片放入不銹鋼底座里，放入墊片和0型圈，將螺蓋和杯體蓋緊組裝成一套完整的全封閉過濾培養器。 
4.4.3 滅菌，用牛皮紙將組裝好的培養器包好，放入高壓濕熱滅菌鍋里，121℃,0.1MPa進行滅菌。 
4.4.4 取滅菌好的培養器至微生物限度檢定室，進行集菌過濾。 
4.4.5 打開配制好的固體培養基，將集菌好的濾膜平帖在培養基上（濾膜上不可以有氣泡產生）。 
4.4.6 按照規定進行培養。 
4.5 注意事項 
4.5.1 在集菌儀泵頭合上之前（需扣緊蠕動泵東快），嚴禁啟動開關，否則將可能倒置手部受傷。 
4.5.2 若無菌室采用化學消毒劑消毒時，應將儀器移至封閉罩內，或搬出無菌室，以免損壞電子不見和儀器表面。 
4.5.3 應保持取樣針上的過濾膜干燥，氣流暢通，正常進液。方法是在取樣針插入瓶裝流體樣品時，應先開機，然后倒置容器瓶。 
4.5.4 若敬業管內出現過多氣泡，應將泵速降低，并檢查進氣濾膜是否被浸泡，若不能進液，則檢查進液針是否暢通。